Ⅱ級生物安全柜有前窗操作口,向安全柜內流入的氣流用于人員保護,經高效過濾器過濾的下降氣流用于產品保護,安全柜內氣流經高效過濾器過濾后排出用于環境保護。安全柜按排放氣流占系統總流量的比例及內部設計結構分為A1、A2、B1、B2共四種類型。  

A1 型安全柜前窗氣流速度較小量或測量平均值應至少為0.38m/s。70%氣體通過HEPA 過濾器再循環至工作區，30%的氣體通過排氣口過濾排除。  

A2 型安全柜前窗氣流速度較小量或測量平均值應至少為0.5m/s。70%氣體通過HEPA 過濾器再循環至工作區，30%的氣體通過排氣口過濾排除。  Ⅱ級B 型生物安全柜均為連接排氣系統的安全柜。連接安全柜排氣管的風機連接緊急供應電源，目的在斷電下仍可保持安全柜負壓，以免危險氣體泄漏如實驗室。其前窗氣流速度較小量或測量平均值應至少為0.5m/s(100fpm)。

B1 型70%氣體通過排氣口HEPA 過濾器排除，30%的氣體通過供氣口HEPA 過濾器再循環至工作區。

B2 型為100%全排型安全柜，無內部循環氣流，可同時提供生物性和化學性的安全控制。